Prototype

《原型兵器》是兩部系列作品中的第一部，玩家將操控亞歷克斯·默瑟，在曼哈頓對抗名為「黑光」的病毒爆發。亞歷克斯本人也感染了病毒，因而獲得特殊、突變的能力，這些能力會隨著時間進化，並幫助他阻止病毒擴散。

遊戲故事圍繞亞歷山大·J·默瑟（由巴里·佩珀配音）展開，他在曼哈頓基因工程公司Gentek地下室的停屍間醒來，嚇跑了兩名正準備進行解剖的科學家。亞歷克斯逃脫，並目睹科學家被軍事人員槍殺。亞歷克斯被發現並遭到攻擊，他承受了射入胸膛的子彈，跳過牆壁逃到安全地帶。他很快發現自己擁有強大的變形能力、超人般的力量、速度、敏捷性、耐久力、感官、耐力、武器，以及透過「吞噬」他人來獲取記憶、技能和外貌的能力。由於對過去毫無記憶，亞歷克斯決定找出並吞噬與陰謀相關的人，以揭開真相。在旅程中，亞歷克斯面對兩大陣營：美國海軍陸戰隊與黑光部隊（一支隸屬於德特里克堡、專注於生物戰的特種部隊），以及被稱為「感染者」的怪物——這些怪物是由肆虐曼哈頓的「黑光」病毒所創造。黑光軍官羅伯特·克羅斯上尉（由傑弗里·皮爾斯配音）奉命找到並控制亞歷克斯。亞歷克斯與他的妹妹戴娜（由萊克·貝爾配音）取得聯繫，戴娜協助他鎖定目標，進而潛入Gentek總部。他在大樓內發現一名名為伊莉莎白·葛林的年輕女子被囚禁。葛林是「黑光」病毒的宿主，逃脫後將病毒釋放到曼哈頓。戴娜指引亞歷克斯去找他的前女友凱倫·帕克。凱倫同意協助他阻止病毒，但要求亞歷克斯帶回病毒樣本。凱倫後來設下陷阱，讓亞歷克斯與克羅斯對決。戰鬥中，亞歷克斯幾乎擊敗克羅斯，但克羅斯提到「賓州車站」，觸發了亞歷克斯的記憶片段，使他陷入恍惚。亞歷克斯被注射了寄生蟲，生命垂危。他向與Gentek有關的病理學家雷格蘭博士求助。雷格蘭幫助亞歷克斯移除寄生蟲，並將其轉化為對付葛林的武器。然而，這對葛林無效，因為她的身體立即排斥了寄生蟲，被排斥的生物質形成了一個 monstrous 的存在——「至高獵手」，亞歷克斯將其擊殺。透過一名聯絡人，病毒和伊莉莎白·葛林的起源被揭露：1969年，政府在愛達荷州希望鎮測試了病毒的前身，該病毒設計用於針對特定種族。病毒突變為更致命的型態，整個城鎮的人口都被感染。伊莉莎白·葛林是唯一的倖存者；她身體的生物學異常接納了病毒，改寫了她的基因密碼，以及她未出生兒子的基因密碼，代號為「帕里亞」。希望鎮的其餘居民被黑光部隊消滅。葛林和帕里亞被囚禁以進行進一步研究。亞歷克斯發現了自己的過去：黑光部隊因洩密而關閉了Gentek計畫，並下令消滅所有計畫人員。亞歷克斯·默瑟帶走了一份「黑光」病毒樣本作為「保險」。最終，他在賓州車站被黑光部隊包圍。在絕望與復仇的最後一刻，亞歷克斯打碎了裝有「黑光」病毒的試管，釋放了病毒，隨後被槍殺。病毒透過子彈孔進入默瑟的血液，在細胞層面修復了他的身體。聯絡人和亞歷克斯將一種名為「血毒」的新型生物製劑注入地下，以將病毒驅趕到地面，便於直接對抗，這迫使葛林以巨大的怪物形態現身。葛林被擊敗後從怪物身上以人類形態墜落，並被亞歷克斯吞噬。