Prototype

『Prototype』は2部作の第1作目で、プレイヤーはアレックス・マーサーを操作し、マンハッタンで蔓延するウイルス「ブラックライト」による感染爆発を阻止するために戦います。アレックス自身もウイルスに感染しており、その結果、時間とともに進化する特殊な変異能力を獲得し、ウイルスを止める手助けとなります。

物語は、マンハッタンに拠点を置く遺伝子工学企業ジェンテックの地下遺体安置所で目覚めたアレクサンダー・J・マーサー（声：バリー・ペッパー）から始まる。彼は解剖をしようとしていた2人の科学者を驚かせて逃げ出し、科学者たちが軍の工作員に射殺されるのを目撃する。アレックスは発見され攻撃されるが、胸に銃弾を受けても生き延び、壁を飛び越えて安全な場所へ逃れる。彼はすぐに、強力な変身能力、超人的な力、スピード、敏捷性、耐久力、感覚、持久力、武器能力、そして人を「吸収」して記憶やスキル、外見を得る能力を手に入れたことに気づく。過去の記憶を失ったアレックスは、陰謀に関わる者たちを見つけ出して吸収し、真実を明らかにすることを決意する。彼の旅の途中で、アレックスは2つの勢力に直面する：アメリカ海兵隊と、生物兵器対策に特化したフォート・デトリックの特殊部隊ブラックウォッチ、そしてマンハッタンを席巻するウイルス「ブラックライト」によって生み出されたモンスター「インフェクテッド」である。ブラックウォッチの将校ロバート・クロス大尉（声：ジェフリー・ピアース）は、アレックスを見つけ出し封じ込めるよう命令を受ける。アレックスは妹のダナ（声：レイク・ベル）と連絡を取り、彼女の助けを借りて標的を追跡し、ジェンテック本部への潜入に成功する。そこで彼は建物に閉じ込められたエリザベス・グリーンという若い女性を発見する。グリーンはブラックライトの宿主であり、彼女が脱出するとウイルスがマンハッタンに解き放たれる。ダナはアレックスを元恋人カレン・パーカーに導く。カレンはウイルスを止める手助けを約束する一方、アレックスにウイルスのサンプルを持ち帰るよう要求する。後にカレンはアレックスを罠にかけ、クロスと対決させる。戦闘中、アレックスがクロスをほぼ倒した時、クロスが「ペン・ステーション」という言葉を口にし、それがフラッシュバックを引き起こしてアレックスは混乱する。アレックスは寄生虫を注入され、死の危機に瀕する。彼はジェンテックに関連する病理学者ラグランド博士に助けを求める。ラグランドはアレックスが寄生虫を除去し、それをグリーンに対する武器に変えるのを助ける。しかし、グリーンはすぐに寄生虫を拒絶したため効果はなく、拒絶されたバイオマスは「スプリームハンター」という恐ろしい存在となり、アレックスはそれを倒す。ウイルスとエリザベス・グリーンの起源は、ある連絡先を通じて明らかになる：1969年、政府はアイダホ州ホープでウイルスの前身をテストし、特定の人種を標的にするよう設計されていた。ウイルスははるかに致命的なものに変異し、町全体が感染した。エリザベス・グリーンは唯一の生存者であり、彼女の体内の異常がウイルスを受け入れ、遺伝子コードを書き換え、胎児（コードネーム「パライア」）とともに変異させた。残りのホープの住民はブラックウォッチによって処分された。グリーンとパライアはさらなる研究のために監禁された。アレックスは自身の過去を知る：ブラックウォッチは情報漏洩によりジェンテック計画を中止し、関係者全員の排除を命じた。アレックス・マーサーは「保険」としてブラックライトのサンプルを持ち出した。最終的にペン・ステーションでブラックウォッチに追い詰められたアレックスは、最後の絶望と復讐の行動としてブラックライトの入ったバイアルを割り、ウイルスを放出した後、射殺される。ウイルスはマーサーの血流に銃創から侵入し、細胞レベルで彼の体を修復した。連絡先とアレックスは、ウイルスを地下から地上に追い出し直接戦えるよう、新しい生物剤「ブラッドトックス」を地下に注入する。これによりグリーンが巨大な怪物に包まれて出現する。グリーンは倒されると人間の姿で怪物から落下し、アレックスに吸収される。